חזרה

סילבוס

מספר קורס 0421-3815-01
שם הקורס מידול מערכות ביולוגיות
יחידה אקדמית הפקולטה למדעי החיים ע"ש ג'ורג' ס. וייז -
מחלקה לביוכימיה וביולוגיה מולקולרית
מרצה פרופ' אביגדור אלדרצרו קשר
מרצה פרופ' יפתח נחמןצרו קשר
מרצה פרופ' דוד שפרינצקצרו קשר
צור קשר דוא"ל: avigdore@tauex.tau.ac.il
שעות קבלה בתאום מראשבניין: בניין גרין - ביוטכנולוגיה , חדר: 134
צור קשר דוא"ל: iftachn@tauex.tau.ac.il
שעות קבלה בתאום מראשבניין: שרמן - מדעי החיים , חדר: 506
צור קשר דוא"ל: davidsp@tauex.tau.ac.il
שעות קבלה בתאום מראשבניין: שרמן - מדעי החיים , חדר: 508
אופן ההוראה שיעור
שעות סמסטריאליות 3
סמסטר ב' תשפ"ג
יום א
שעות 09:00-12:00
בניין בריטניה - מדעי החיים
חדר 006
אין סילבוס

תוכן הקורס ומטרתו

תאים צריכים לקבל החלטות לעתים קרובות - אם להתחלק או להתמיין, איך ומתי להגיב ללחץ חיצוני, או כיצד לתאם שינוי עם תאים סמוכים. בכדי לבצע זאת, מידע רלוונטי מן הסביבה החיצונית והפנימית של התא מעובד ע"י רשתות גנטיות, אשר מביאות לתגובות המתאימות. בעקבות זיהויים של מרכיבים רבים מרשתות אלה והאינטראקציות ביניהן בגישות של ביולוגיה מולקולרית וגנומיקה, תשומת לב רבה מופנית להבנת מאפיינים כמותיים של פעולת הרשתות, כיצד הן מעבדות מידע ומובילות ליצירת התהליכים התאיים הנצפים. ביולוגיה של מערכות מנסה לענות על השאלות האלה באמצעות גישה המשלבת ראייה אינטגרטיבית של עיבוד תאי עם מושגי יסוד של בקרה מן ההנדסה.

בקורס נציג מושגים אלה באמצעות ניתוח של דוגמאות ספציפיות ממערכות ביולוגיות. כמו-כן נציג מספר כלים מתמטיים לניתוח של רשתות גנטיות, ונשלב התנסות בסימולציות פשוטות באמצעות MATLAB או Python.
באמצעות מערכות ספציפיות כגון החלטות התמיינות בשמרים וחיידקים, גרדיאנטים של מורפוגן בזבוב, ויצירת תבניות מרחביות בהתפתחות על-ידי מערכת Notch-Delta נציג מושגים בסיסיים בקבלת החלטות ותגובה תאית, כגון:
* יחסי קלט פלט בהתמרת אותות
* מצבים תאיים ושינויי מצב
* משוב שלילי וחיובי
* עמידות ושונות
* היווצרות תבניות מרחביות
* תנודות מחזוריות

הקורס מיועד הן לתלמידי ביולוגיה המתעניינים בהיבטים כמותיים של בקרה, כמו גם לתלמידי פיזיקה, כימיה, והנדסה המעוניינים במחקר בינתחומי בממשק עם ביולוגיה. הקורס פתוח לתלמידי שנה שלישית ולתארים מתקדמים.
מספר שעות: 3 שעות
שיטת ההוראה: הרצאות
ציונים: מבוסס על מבחן סופי (בכתב) ו-3 תרגילים.
ידע מוקדם: ידע בסיסי של Python או Matlab או לקיחה במקביל עם קורס מבוא לאחת משפות אלו. ידע ברמת קורס בסיסי בביולוגיה מולקולארית.



לסילבוס המפורט
מטלות הקורס

בחינה סופית

ייתכנו מטלות נוספות
רשימת המטלות המלאה תופיע בסילבוס המפורט של הקורס.

דרישות קדם ספציפיות בקורס בהתאם לתוכנית הלימודים הנלמדת,
מופיעות בדף הידיעון של התוכנית



tau logohourglass00:00